A történet színtere Sugomori, egy fiktív japán város, amely lassacskán elnéptelenedik. Itt jár iskolába Agata Katsuhira, akit egy nap azzal fogad a rejtélyes és keveset beszélő osztálytársnője, Sonosaki Noriko, hogy a fiút beválasztották a világbéke megteremtése érdekében létrehozott Kizuna Rendszerbe mint Kiznaivert. A rendszer lehetővé teszi, hogy Katsuhira a bevetések során elszenvedett sérüléseit továbbítsa és elossza azon osztálytársai között, akik vele együtt szintén Kiznaiverek lettek.