A Legend of Mana egy kitalált világban játszódik, aminek a neve Fa’Diel. A Mana fa, a mana és a világ életének adója, majdnem teljes egészében leégett kilenc évszázaddal az anime eseményei előtt. Háború tört ki az emberek, tündérek, és más fajok között, akik a mana maradék erejét kereseték. Amikor a háború befejeződött, a leégetett Mana fa újból aludni tért, és a világ sok földjét ősi tárgyakba zárták. A hős, Shiloh, igyekszik helyreállítani a világot és a manát korábbi valójához, ekkor találkozik Rurival és Shinju-himevel is. Fa’Diel földjein sokféle teremtmény él: emberek, tündérek, démonok, ékszer-szívű Jumi faj és még sok más egyéb faj, köztük antropomorf állatok és tárgyak is.