A filmet, akárcsak az első évadot, Haruka egyéni úszása indítja, ugyanis már megint magától ment el úszni. Makoto viszont nemsokára érte jön, mivel sietniük kell, a cseresznyefák már javában virágoznak, kezdetét veszi első alsó-középiskolás évük az Iwatobi Alsó-Középiskolában. Ekkor már Rin Ausztrália egyik úszócsapatát erősíti, hogy beteljesítse álmát, és olimpikon válhasson belőle.