Mouri Kogorót egy különleges esethez hívják az ősi fővárosba, Kiotóba. Conan ott találkozik Heijivel, és újra összefognak, hogy megoldják az ügyet, visszaszerezzék az ellopott Gyógyító Buddha-szobrot, és még Heiji első szerelmének kilétét is kiderítsék